[R-es] Calibrar y validar nomograma

[JOSE MARTIN AREVALO]

Hola a todos! Espero que me pod�is ayudar porque estoy un poco atascado.
He hecho un modelo de regresi�n de Cox para la supervivencia a 3 a�os de pacientes con c�ncer colorrectal en funci�n de una serie de factores. De la muestra total de unos 1000 casos, cre� dos grupos: uno de entrenamiento y otro de test. El modelo lo hice con el grupo de entranamiento. La asignaci�n de los pacientes a cada grupo lo hice de forma aleatoria a trav�s de la librer�a CaTools, en una proporci�n 70/30.

Bueno, he conseguido hacer el nomograma a partir del modelo basado en la regresi�n de Cox con la librer�a rms, pero ahora no s� c�mo calibrarlo y validarlo.

He intentado utilizar "calibrate" del paquete "rms", pero me pierdo en c�mo hacerlo. Soy incapaz de crear una variable con las predicciones.

He visto que hab�a una charla sobre el tema de Luis Mariano Estaban y colaboradores de la que se hab�an extra�do unas diapositivas, pero no acabo de entender bien c�mo lo hacen. Lo que me ha parecido entender es que primero ten�an que hacer que el modelo predijese resultados a partir de la muestra de test y luego, se hac�a la calibraci�n.

Otra cosa que me resultar�a interesante es hacer una gr�fica donde se vea la regresi�n de Cox del modelo y la curva correspondiente a las predicciones de �ste. Entiendo que se deber�a hacer con la muestra de test o prueba.

Os estar�a muy agradecido si me pudi�seis dar informaci�n de c�mo hacerlo o ejemplos con el c�digo para ver si soy capaz de adaptarlo a mi estudio.

Bueno, muchas gracias a todos

Pepe Mart�n

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