[R-es] Construcción de archivo de texto
Marcelino de la Cruz Rot
m@rcelino@del@cruz @ending from urjc@e@
Mar Jul 10 17:45:27 CEST 2018
O más fácil aún:
sink(file="datos3.txt")
for (i in 1:length(d)){
cat(paste("Pedigree: ",unique(d[[i]]$ped),"\n"))
print(d[[i]],row.names=F)
}
sink()
El 10/07/2018 a las 17:39, Marcelino de la Cruz Rot escribió:
> O así, también:
>
>
> file="datos.txt"
>
> for (i in 1:length(d)){
> di<-d[[i]]
> nc<-ncol(di)
>
> write(paste("Pedigree: ", unique(di$ped)),file=file, append=TRUE)
> write(colnames(di),file=file, sep = "\t", ncolumns=nc, append=TRUE)
> write(t(as.matrix(di)), file=file, sep = "\t", ncolumns=nc,
> append=TRUE)
> }
>
>
> Saludos,
>
>
>
>
>
> El 10/07/2018 a las 17:07, Freddy Omar López Quintero escribió:
>> Hola.
>>
>> Con variantes de esto:
>>
>> cat(file='probando.txt')
>> for (i in 1:length(d)){
>> cat(paste("Pedigree: ",unique(d[[i]]$ped),"\n"),
>> file='probando.txt', append=T)
>> capture.output(print(d[[i]],row.names=F),
>> file='probando.txt', append=T)
>> }
>>
>>
>> Se podría hacer.
>>
>> Saludos.
>>
>> On Tue, Jul 10, 2018 at 9:58 AM Jorge I Velez
>> <jorgeivanvelez using gmail.com <mailto:jorgeivanvelez using gmail.com>> wrote:
>>
>> Gracias, Marcelino. Alguna idea sobre cómo almacenarlo en un
>> archivo de
>> texto?
>> Saludos,
>> Jorge.-
>>
>>
>>
>> On Tue, Jul 10, 2018 at 5:13 AM Marcelino de la Cruz Rot <
>> marcelino.delacruz using urjc.es <mailto:marcelino.delacruz using urjc.es>>
>> wrote:
>>
>> > Hola. A ver esto, qué tal:
>> >
>> >
>> > for (i in 1:length(d)){
>> > cat(paste("Pedigree: ",unique(d[[i]]$ped),"\n"))
>> > print(d[[i]],row.names=F)
>> >
>> > }
>> >
>> > Saludos,
>> >
>> > Marcelino
>> >
>> >
>> >
>> > El 10/07/2018 a las 11:31, Jorge I Velez escribió:
>> > > Hola a todos,
>> > >
>> > > A partir de los siguientes datos:
>> > >
>> > > d <- list(`1` = structure(list(ped = c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L,
>> 1L),
>> > > id = 1:7, father = c(2L, 0L, 0L, 2L, 2L, 2L, 2L), mother
>> = c(3L,
>> > > 0L, 0L, 3L, 3L, 3L, 3L), sex = c(2L, 1L, 2L, 2L, 2L, 1L,
>> > > 2L), affected = c(1L, 2L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L)), row.names
>> = c("1",
>> > > "2", "3", "4", "5", "6", "7"), class = "data.frame"), `2` =
>> > structure(list(
>> > > ped = c(2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L,
>> > > 2L), id = 201:214, father = c(0L, 0L, 0L, 201L, 201L, 201L,
>> > > 201L, 201L, 0L, 203L, 203L, 209L, 209L, 209L), mother =
>> c(0L,
>> > > 0L, 0L, 202L, 202L, 202L, 202L, 202L, 0L, 204L, 204L, 208L,
>> > > 208L, 208L), sex = c(1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 2L, 2L, 1L,
>> > > 1L, 1L, 2L, 1L, 1L), affected = c(1L, NA, 1L, 0L, NA, 1L,
>> > > 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L)), row.names = c("42", "43",
>> > > "44", "45", "46", "47", "48", "49", "50", "51", "52", "53",
>> "54",
>> > > "55"), class = "data.frame"))
>> > > d
>> > >
>> > > estoy interesado en obtener un archivo de texto "out.txt" con la
>> > siguiente
>> > > estructura:
>> > >
>> > >
>> > > pedigree: 1
>> > > ped id father mother sex affected
>> > > 1 1 2 3 2 1
>> > > 1 2 0 0 1 2
>> > > 1 3 0 0 2 1
>> > > 1 4 2 3 2 1
>> > > 1 5 2 3 2 2
>> > > 1 6 2 3 1 2
>> > > 1 7 2 3 2 2
>> > > pedigree: 2
>> > > ped id father mother sex affected
>> > > 2 201 0 0 1 1
>> > > 2 202 0 0 2 NA
>> > > 2 203 0 0 1 1
>> > > 2 204 201 202 2 0
>> > > 2 205 201 202 1 NA
>> > > 2 206 201 202 2 1
>> > > 2 207 201 202 2 1
>> > > 2 208 201 202 2 0
>> > > 2 209 0 0 1 0
>> > > 2 210 203 204 1 0
>> > > 2 211 203 204 1 0
>> > > 2 212 209 208 2 0
>> > > 2 213 209 208 1 0
>> > > 2 214 209 208 1 1
>> > >
>> > >
>> > > La idea es relativamente simple: guardar cada data.frame de
>> "d" sin row
>> > > labels y con el encabezado "pedigree: " seguido del número en
>> la columna
>> > > "ped".
>> > >
>> > > Alguna idea? Por supuesto esto es una versión muy reducida
>> del problema
>> > > real.
>> > >
>> > > Muchísimas gracias por su ayuda.
>> > >
>> > > Saludos cordiales,
>> > > Jorge.-
>> > >
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