[R-es] Construcción de archivo de texto

Javier Marcuzzi j@vier@ruben@m@rcuzzi @ending from gm@il@com
Mar Jul 10 16:51:30 CEST 2018


Estimado Jorge I Velez

Yo lo guardaría en json, porque si es txt habría que encontrar los
"encabezados", cosa que en json están ubicados en el archivo y al procesar
los reconoce, pero el inconveniente es un archivo más grande.

Javier Rubén Marcuzzi

El mar., 10 jul. 2018 a las 10:58, Jorge I Velez (<jorgeivanvelez using gmail.com>)
escribió:

> Gracias, Marcelino.  Alguna idea sobre cómo almacenarlo en un archivo de
> texto?
> Saludos,
> Jorge.-
>
>
>
> On Tue, Jul 10, 2018 at 5:13 AM Marcelino de la Cruz Rot <
> marcelino.delacruz using urjc.es> wrote:
>
> > Hola. A ver esto, qué tal:
> >
> >
> > for (i in 1:length(d)){
> >       cat(paste("Pedigree: ",unique(d[[i]]$ped),"\n"))
> >       print(d[[i]],row.names=F)
> >
> > }
> >
> > Saludos,
> >
> > Marcelino
> >
> >
> >
> > El 10/07/2018 a las 11:31, Jorge I Velez escribió:
> > > Hola a todos,
> > >
> > > A partir de los siguientes datos:
> > >
> > > d <- list(`1` = structure(list(ped = c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L),
> > >      id = 1:7, father = c(2L, 0L, 0L, 2L, 2L, 2L, 2L), mother = c(3L,
> > >      0L, 0L, 3L, 3L, 3L, 3L), sex = c(2L, 1L, 2L, 2L, 2L, 1L,
> > >      2L), affected = c(1L, 2L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L)), row.names = c("1",
> > > "2", "3", "4", "5", "6", "7"), class = "data.frame"), `2` =
> > structure(list(
> > >      ped = c(2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L,
> > >      2L), id = 201:214, father = c(0L, 0L, 0L, 201L, 201L, 201L,
> > >      201L, 201L, 0L, 203L, 203L, 209L, 209L, 209L), mother = c(0L,
> > >      0L, 0L, 202L, 202L, 202L, 202L, 202L, 0L, 204L, 204L, 208L,
> > >      208L, 208L), sex = c(1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 2L, 2L, 1L,
> > >      1L, 1L, 2L, 1L, 1L), affected = c(1L, NA, 1L, 0L, NA, 1L,
> > >      1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L)), row.names = c("42", "43",
> > > "44", "45", "46", "47", "48", "49", "50", "51", "52", "53", "54",
> > > "55"), class = "data.frame"))
> > > d
> > >
> > > estoy interesado en obtener un archivo de texto "out.txt" con la
> > siguiente
> > > estructura:
> > >
> > >
> > > pedigree: 1
> > > ped id father mother sex affected
> > >    1  1      2      3   2        1
> > >    1  2      0      0   1        2
> > >    1  3      0      0   2        1
> > >    1  4      2      3   2        1
> > >    1  5      2      3   2        2
> > >    1  6      2      3   1        2
> > >    1  7      2      3   2        2
> > > pedigree: 2
> > > ped  id father mother sex affected
> > >    2 201      0      0   1        1
> > >    2 202      0      0   2       NA
> > >    2 203      0      0   1        1
> > >    2 204    201    202   2        0
> > >    2 205    201    202   1       NA
> > >    2 206    201    202   2        1
> > >    2 207    201    202   2        1
> > >    2 208    201    202   2        0
> > >    2 209      0      0   1        0
> > >    2 210    203    204   1        0
> > >    2 211    203    204   1        0
> > >    2 212    209    208   2        0
> > >    2 213    209    208   1        0
> > >    2 214    209    208   1        1
> > >
> > >
> > > La idea es relativamente simple:  guardar cada data.frame de "d" sin
> row
> > > labels y con el encabezado "pedigree: " seguido del número en la
> columna
> > > "ped".
> > >
> > > Alguna idea?  Por supuesto esto es una versión muy reducida del
> problema
> > > real.
> > >
> > > Muchísimas gracias por su ayuda.
> > >
> > > Saludos cordiales,
> > > Jorge.-
> > >
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> > Marcelino de la Cruz Rot
> > Depto. de Biología y Geología
> > Física y Química Inorgánica
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