[R-es] Error K-MEDIAS, paquete NbClust windows 10, 64 bits

[Cesar Vanegas Castro]

Cordial Saludo.


Muchas gracias por las respuestas


En realidad no tengo mucha experiencia con este error, y tampoco con R, estoy intentando aplicar las soluciones que me proponen, pero creo que no lo estoy haciendo bien, podrian porfavor ser un poco mas especificios, muchas gracias.


-en el caso de la respuesta de vegeta8504, intente modificando el codigo con el vector asi.

nb <- NbClust(datos.scaled, distance = "euclidean", min.nc = 2,
        max.nc = 10, method = "complete", index =c("kl", "ch", "hartigan", "ccc", "scott", "marriot", "trcovw", "tracew", "friedman", "rubin", "cindex", "db", "silhouette", "duda", "pseudot2", "beale", "ratkowsky", "ball", "ptbiserial", "gap", "frey", "mcclain", "gamma", "gplus", "tau", "dunn", "hubert", "sdindex", "dindex", "sdbw")), pero me genera el mismo error.

-el que me propone Carlos J. Gil Bellosta, en realidad no se como aplicarlo

y el que me propone Carlos Ortega , la parte del gc(), misdatos son estos


used (Mb) gc trigger   (Mb)  max used   (Mb)
Ncells  3780595  202    6861544  366.5   6861544  366.5
Vcells 23985417  183  767099548 5852.6 836729210 6383.8

pero no se que mas hacer de ahi.


  *   gc() - para activar el garbage collector.
  *   Y podrías pre-dimensionar ("allocate") un vector de 2Gb con el mismo nombre de la variable "nb" para que "NbClust" cuando genere su salida ya encuentre un espacio reservado en esa variable.

Gracias por su ayuda

cesar




________________________________
De: vegeta8504 . <vegeta8504 en gmail.com>
Enviado: lunes, 16 de enero de 2017 11:26 a. m.
Para: Carlos J. Gil Bellosta
Cc: r-help-es en r-project.org; Cesar Vanegas Castro
Asunto: Re: [R-es] Error K-MEDIAS, paquete NbClust windows 10, 64 bits


Lo que pasa es que utilizas "all" en index y te corre todos los métodos y hay métodos para datos binarios no binarios y creo que para otros tipos de datos. Dependiendo de tus datos debes utilizar los métodos que te sirvan para tú problema. Esto lo ves en la ayuda, yo pegué los nombres de los métodos desde la ayuda y lo escribí en R en forma de vector y así descarté los que no me servian. Saludos

El 16/01/2017 13:02, "Carlos J. Gil Bellosta" <cgb en datanalytics.com<mailto:cgb en datanalytics.com>> escribió:
Hola, ¿qué tal?

Si R crea la matriz de distancias necesitarás, como poco, 29*29*8 MB
de RAM. Puede ser mucho para tu equipo. Trata de correr el código
usando subconjuntos de datos (1%, 5%, 10%, etc.) para ver desde fuera
cuánta RAM estás consumiendo.

Salud,

Carlos J. Gil Bellosta
http://www.datanalytics.com

El día 16 de enero de 2017, 16:32, Cesar Vanegas Castro
<Ing.CesarVanegas en hotmail.com<mailto:Ing.CesarVanegas en hotmail.com>> escribió:
> Buenos dias, desde hace algunos dias estoy realizando un trabajo,mi computadora es una DELL, windows 10 64 bits, 8G de RAM y disco de estado solido, estoy procesando 29000 filas y 23 columnas, mi codigo es este:
>
> nb <- NbClust(datos.scaled, distance = "euclidean", min.nc<http://min.nc> = 2,
>         #max.nc<http://max.nc> = 10, method = "complete", index ="all")
> .
>
> y mi error es este:
>
> Error: cannot allocate vector of size 2.0 Gb
>
>
> Gracias
>
>
>
>         [[alternative HTML version deleted]]
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