[R-es] STATA base de datos

[Antonio Rodriguez Andres]

Carlos
He tecleado lo siguiente para leer el fichero de Stata

library(foreign)
datos = as.data.frame(read.dta("private98-06more_than9.dta"))
save(datos, file="data.RData")
load("data.RData")
dim(datos)
class(datos)

Tiene ese numero de filas y columnas que son las variables.

 dim(datos)[1] 9418455      28

Mi memoria RAM es 4GB, pero he conseguido leer los datos, y tambien
hacer un histograma de age, aunque es dificil ver algo por la cantidad
de individuos que hay en la base de datos.

hist(datos$age, main="Titulo", xlab="Age")

Ya cuando intento ver los valores perdidos con

is.na(datos) me sale error


Error: cannot allocate vector of size 1006.0 Mb

Saludos



2017-12-06 13:49 GMT+01:00 Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>:

> OK.
> Lee primero los datos, guarda el data.frame (.RData o en un .csv o lo que
> quieras).
> Sal de RStudio o incluso reinicia el ordenador para liberar el máximo de
> memoria.
>
> Y comienza una nueva sesión con RStudio cargando los datos con "fread()".
> Por otro lado, este conjunto de datos ¿cómo es de grande (filas y
> columnas)?.
>
> ¿Y qué máquina tienes?. ¿Cuanta RAM tienes?.
>
> Gracias,
> Carlos.
>
>
> El 6 de diciembre de 2017, 13:42, Antonio Rodriguez Andres <
> antoniorodriguezandres70 en gmail.com> escribió:
>
>> Carlos
>>
>> use library foreign, y read.dta. Consegui leer los datos. Pero demora
>> mucho. explore los datos con head y tail, y con summary. Conseguis los
>> resultados. Muy lento. Una cosa a. hacer es un histograma y ahi ya ponia
>> cannot allocate memory.
>>
>> Pense que podria leer los datos de otra manera mas eficiente.
>>
>> El 6/12/2017 13:32, "Carlos Ortega" <cof en qualityexcellence.es> escribió:
>>
>>> Pero entonces, ¿has leído ya el fichero en RStudio? ¿lo has convertido
>>> de Stata a csv o algún otro formato que con el que puedas trabajar en
>>> RStudio?.
>>> ¿O ahora el problema es que has convertido el fichero pero no puedes
>>> hacer ningún tipo de análisis porque tu equipo no tiene suficientes
>>> recursos?...
>>>
>>> Gracias,
>>> Carlos.
>>>
>>> El 6 de diciembre de 2017, 13:09, Antonio Rodriguez Andres <
>>> antoniorodriguezandres70 en gmail.com> escribió:
>>>
>>>> He llegado hacer un summary o algo asi. Despues de leerlo pero tarda
>>>> mucho.
>>>> Y si hago un histograma de una variable edad, hay colapsa.
>>>>
>>>> El 6/12/2017 13:05, "Antonio Rodriguez Andres" <
>>>> antoniorodriguezandres70 en gmail.com> escribió:
>>>>
>>>> > Freddy
>>>> >
>>>> > el archivo lo leo en segundos en Stata. puedo probar el paquete
>>>> heaven.
>>>> > Pero si recuerdo me dio problemas en RStudio
>>>> >
>>>> > El 6/12/2017 13:03, "Freddy Omar López Quintero" <
>>>> freddy.vate01 en gmail.com>
>>>> > escribió:
>>>> >
>>>> >> El mié, 06-12-2017 a las 12:55 +0100, Antonio Rodriguez Andres
>>>> escribió:
>>>> >>
>>>> >> me sale problema
>>>> >> de memoria.
>>>> >>
>>>> >>
>>>> >> Pregunta posiblemente tonta: ¿tienes suficiente memoria para
>>>> procesar un
>>>> >> archivo de tales dimensiones? Puede que ni aún cambiando la manera
>>>> de leer
>>>> >> el archivo realmente lo puedas procesar.
>>>> >>
>>>> >>
>>>> >> Entonces, una solucion es intentar pasar de STATA a CSV y luego usar
>>>> el
>>>> >> comando fread, y finalmente cargar los datos como RData
>>>> >>
>>>> >>
>>>> >> ¿Has probado el paquete haven y específicamente su función read_dta?
>>>> >> Parece que es bastante más eficiente que la de foreign y preserva más
>>>> >> características que trae el formato de stata.
>>>> >>
>>>> >> ¡Ojalá algo sirva!
>>>> >>
>>>> >> ¡Salud!
>>>> >>
>>>> >> --
>>>> >>
>>>> >> «...homines autem hominum causa esse generatos...»
>>>> >>
>>>> >> Cicero
>>>> >>
>>>> >
>>>>
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>>> Saludos,
>>> Carlos Ortega
>>> www.qualityexcellence.es
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