[R-es] igraph V a partir de E y subgrafos

[Luisfo]

Estimado Javier,

Te respondo a esto rápidamente.

Pienso como tú, que el resultado de /subgraph.edges/ e 
/induced.subgraph/ debería ser el mismo. No se me ocurre ahora mismo 
ningún caso donde no sea así.
Sin embargo,/subgraph.edges/ tiene un tercer parámetro opcional por si 
quieres conservar los vértices, a pesar de que desaparezcan todas sus 
aristas.

Para colocar más de un filtro en la 'query' de edges, se pueden 
concatenar con comas ( , ), haciendo la función de ORs.
Ejemplo:
     plot(subgraph.edges(datos.network, E(datos.network)[[inc('Casa'), 
inc('otro filtro'), ... ]]))

Un saludo,

*Luisfo Chiroque*
/PhD Student | PhD Candidate
IMDEA Networks Institute/
http://fourier.networks.imdea.org/people/~luis_nunez/ 
<http://fourier.networks.imdea.org/people/%7Eluis_nunez/>


On 09/06/2016 03:55 PM, javier.ruben.marcuzzi en gmail.com wrote:
>
> Estimado Luisfo
>
> Gracias por la acotación, tendía que ver ese cambio, hora ¿el 
> resultado sería el mismo al crear el subgrafo o hay una diferencia 
> entre el subgrafo entre: subgraph.edges y induced.subgraph? Yo pienso 
> que colocando correctamente los parámetros el resultado no debería ser 
> distinto.
>
> Otra pregunta, hay una forma de colocar más de un filtro en lo siguiente:
>
> plot(subgraph.edges(datos.network, E(datos.network)[[inc(‘Casa’)]]))
>
> a por ejemplo
>
> plot(subgraph.edges(datos.network, E(datos.network)[[inc('Casa')  
> ++++  otro filtro +++]]))
>
> Porque me parece que tendré que filtrar y luego crear los grafos, no 
> estoy dando justo con lo que necesito, me resulta muy fácil crear un 
> montón de igraph(….), pero me parece que sería ineficiente.
>
> Javier Rubén Marcuzzi
>
> *De: *Luisfo <mailto:luisfo89 en yahoo.es>
> *Enviado: *martes, 6 de septiembre de 2016 8:57
> *Para: *javier.ruben.marcuzzi en gmail.com 
> <mailto:javier.ruben.marcuzzi en gmail.com>; R-help-es en r-project.org 
> <mailto:R-help-es en r-project.org>
> *Asunto: *Re: [R-es] igraph V a partir de E y subgrafos
>
> Estimado Javier,
>
> Me alegra que hayas avanzado con tu error.
>
> Te respondo a esto último.
> La función induced.subgraph() espera como segundo parámetro una lista 
> de los IDs de los vértices, mientras que tú le estás pasando una lista 
> de 'edges'.
>
> Prueba lo siguiente:
>
> c <- induced.subgraph(datos.network, which(V(datos.network)$name == 
> 'Casa'))
>
> Si entendí bien todo, debería funcionar.
>
> Un saludo,
>
> *Luisfo Chiroque*
> /PhD Student | PhD Candidate
> IMDEA Networks Institute/
> http://fourier.networks.imdea.org/people/~luis_nunez/ 
> <http://fourier.networks.imdea.org/people/%7Eluis_nunez/>
>
> On 09/05/2016 07:08 PM, javier.ruben.marcuzzi en gmail.com 
> <mailto:javier.ruben.marcuzzi en gmail.com> wrote:
>
>     Estimados
>
>     Encontré una solución, que no comprendo pero arregla uno de los problemas.
>
>     En la preparación de datos tengo varias partes, al final realizo un cbind y luego un merge, esto da error, pero si realizo merge y luego cbind, no hay error (no se “pierde eso que comenté en el correo anterior”).
>
>     Luego igraph crea el grafo y el sub grafo que al graficar es correcto.
>
>     Ahora, porqué esa diferencia, no tengo la menor idea.
>
>     Solo queda el problema de
>
>         c <- induced.subgraph(datos.network, E(datos.network)[[inc('Casa')]])
>
>     Error in .Call("R_igraph_induced_subgraph", graph, vids - 1, impl, PACKAGE = "igraph") :
>
>        At iterators.c:759 : Cannot create iterator, invalid vertex id, Invalid vertex id
>
>       
>
>     Pero hay un avance, por lo menos regreso a la lógica de los libros, aunque me desconcierta el porqué esa diferencia al preparar el data.frame que luego es leído por igraph. En varios años con R y muchísimos errores, es lo primero que me sorprende sin entender nada.
>
>     Javier Rubén Marcuzzi
>
>     De:javier.ruben.marcuzzi en gmail.com
>     <mailto:javier.ruben.marcuzzi en gmail.com>
>
>        [[alternative HTML version deleted]]
>
>     _______________________________________________
>
>     R-help-es mailing list
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>     R-help-es en r-project.org <mailto:R-help-es en r-project.org>
>
>     https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>


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