[R-es] heatmap de matriz diagonal inferior

[Víctor Granda García]

Hola,

Si ya tienes la matriz, puedes usar la orden heatmap.2 del paquete gplots,
que te hace el heatmap y además te dibuja los dendrogramas. Para ver la
ayuda de la orden carga primero el paquete y luego ?heatmap.2

Si m es tu matriz, con:

m[upper.tri(m)] <- t(m)[upper.tri(m)]

consigues que la diagonal superior sea el "espejo" de la inferior y puedes
usar heatmap.2 sin problema:

heatmap.2(m, ....) donde .... indica el resto de opciones que quieres para
el heatmap.

Espero que te sirva,

un saludo!

El sáb., 16 ene. 2016 a las 10:46, Carlos Ortega (<cof en qualityexcellence.es>)
escribió:

> Hola,
>
> ¿Por qué no importas todos los datos y haces todo en R?.
>
>    - Importas datos.
>    - Haces matriz de correlaciones con "cor()"
>    - Y con el paquete "corrplot" haces todos esos gráficos que quieres.
>
> Saludos,
> Carlos.
>
> El 16 de enero de 2016, 10:29, Daviz Parra <ddparrap en gmail.com> escribió:
>
> > Tengo una matriz de de datos (correlación) entre pares de muestras, de
> tipo
> > diagonal inferior, de 250 y quisiera hacer un heatmap y/o un dendrograma.
> >
> > Soy un poco novato y me encuentro con el problema que no se como
> > "importarla" para cargarla e indicar que se trata de una matriz de datos
> de
> > tipo "diagonal inferior" para que R lo interprete y poder realizar un
> > heatmap y/o dendrograma (así como cualquier otro tipo de representación
> y/o
> > análisis)
> > Parece ser sencillo, pero he buscado por internet y no doy con ello, por
> > eso recurro a esta lista.
> > ¿Podrían ayudarme?
> >
> > Gracias
> >
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> Saludos,
> Carlos Ortega
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