[R-es] Procesos paralelos
Carlos J. Gil Bellosta
cgb en datanalytics.com
Mar Abr 12 14:36:49 CEST 2016
Hola, ¿qué tal?
Si la base de datos de destino es SQL Server, ¿por qué no pruebas con
la función dbBulkCopy del paquete
https://github.com/agstudy/rsqlserver? Debería poder cargar millones
de registros en segundos. Al menos, en una única transacción en lugar
de múltiples como con sqlSave.
Un saludo,
Carlos J. Gil Bellosta
http://www.datanalytics.com
El día 12 de abril de 2016, 11:55,
<miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es> escribió:
> Hola José Luis.
>
> Te da algún error? o simplemente no aparece la barra de progreso?
>
> ... y si, en vez de usar winProgressBar(), pruebas con la función tkProgressBar() del paquete tcltk ¿?
>
> Un saludo,
> Miguel.
>
>
>
> El 12/04/2016 a las 11:04, Gilsanz, Jose Luis escribió:
>
> Hola:
>
> Vuelvo a la carga con algo que resolv� hace a�os y que ahora me ha dejado de funcionar y no consigo arreglar. A ver si alguien me sugiere alg�n enfoque o directamente la solucion.
>
> Utilizo R en muchos procesos ETL y la cuesti�n es que me encuentro con que tengo que hacer inserts en un BBDD de SQL Server de varios miles (a veces millones de registros) que mientras R las realiza parece que no est� haciendo nada.
>
> La soluci�n que consegu� hacer en su momento fue paralelizar el proceso de inserci�n en dos procesos distintos usando el paquete snowfall.
> -Un proceso se encargaba de la propia inserci�n de los datos.
> -El otro proceso mostraba una barra de progreso que se constru�a consultando la tabla (tab) donde se insertaban los registros (datos) para monitorizar su proceso.
>
> La subida al servidor es esta funci�n:
>
> subida <- function( datos, tab)
> {
> flush.console()
> canal2 <- odbcDriverConnect( "case=nochange; Driver=xxx; Server=xxx; Database=xxx; uid=xxx; pwd=xxx; wsid=xxx;")
> sqlSave(canal2,datos,tablename= tab, rownames = FALSE, append=TRUE, fast=TRUE )
> close(canal2)
> rm(canal2)
> }
>
> La barra de progreso se toma de esta funci�n:
> pb <-function( datos,tab){
> ##Creamos canal de conexion a BBDD
> canal1 <- odbcDriverConnect( "case=nochange; Driver=SQL Server; Server=xxx; Database=xxx; uid=xxx; pwd=xx; wsid=ESMADN1003;;")
>
> ##Obtenemos conteos de registros##################
> #Numero de registro que se van a cargar
> asubir <- as.numeric(nrow(datos))
>
> #Numero de registro que ya hay en la tabla
> entabla <- as.numeric(sqlQuery(canal1,paste("SELECT Count(*) ", " FROM ",tab, sep="")))
>
> #Numero de registros cargados en el momento n
> total <- as.numeric(0)
>
> #Frecuenca de actualizacion de la barra
> frec <- 0.1
>
> ##Creamos barra de progreso
> barra <- winProgressBar(title="Subiendo datos a SQL ", label = "Subido el: ", min= 0, max= 1,initial= 0, width = 800)
>
> ##Mientras los registros que quedan por subir sean inferiores a los que actualmente hay en la tabla se muestra la barra
> while ( entabla + asubir > total )
> {
> #Reconectamos
> canal1 <- odbcReConnect(canal1)
>
> #Obtenemos registros actuales en la tabla (los que habia + los que han subido hasta el momento)
> total <- as.numeric(sqlQuery(canal1,paste("SELECT Count(*) FROM ",tab, sep="")))
>
> #Calculamos porcentaje de registros subidos en el momento
> porcen <- as.numeric((total - entabla) / asubir)
>
> #Actualizamos barra de progreso
> setWinProgressBar(barra, porcen,title="SUBIENDO DATOS A SQL", label =paste("Subido el: ", round(porcen *100,0), "% de los datos. Quedan por subir ",(entabla + asubir)-total, " registros de ", asubir, "." , sep=""))
>
> #Actualizamos consola
> flush.console()
> Sys.sleep(frec)
> }
> close(barra)
> }
>
> Ahora estoy intentando usar el paquete parallel (en lugar de snowfall que ya no me funciona) haciendo esto.
> library(parallel)
> library(RODBC)
>
> ##Creo un cluster con dos nodos
> cl <-makeCluster(2)
>
> ##Exporto datos y funciones a los dos cluster
> clusterExport(cl,varlist=c("pb","subida","datos","tab"))
>
> ##En el primer cluster hago la inserci�n en el segundo la barra de progreso
> clusterApply(cl,subida(datos,tab),pb(datos,tab) )
>
>
> La inserci�n la realiza correctamente pero la barra de progreso no aparece por ning�n lado :( y en el monitor de procesos aparecen dos Rscript.exe corriendo (uso Windows 7)
>
> Si alguien quiere que le proporcione la funci�n que constru� usando snowfall (y que ahora tampoco muestra la barra) se la puedo enviar para destriparla.
>
> Muchas gracias
>
> Un saludo
>
>
> Jos� Luis Gilsanz G�mez
> Estad�stica
> Departamento T�cnico Entidades Financieras
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