[R-es] Sobre data.table
MªLuz Morales
mlzmrls en gmail.com
Vie Jun 19 17:07:33 CEST 2015
Este es el summary de mi data.table Datos:
> summary(Datos)
In.hospital_death SAPS.I SOFA Age
Gender Height ICUType
Min. :0.0000 Length:4000 Length:4000 Min. :15.00
Length:4000 Length:4000 Min. :1.00
1st Qu.:0.0000 Class :character Class :character 1st Qu.:52.75
Class :character Class :character 1st Qu.:2.00
Median :0.0000 Mode :character Mode :character Median :67.00
Mode :character Mode :character Median :3.00
Mean :0.1385 Mean :64.25
Mean :2.76
3rd Qu.:0.0000 3rd Qu.:78.00
3rd Qu.:4.00
Max. :1.0000 Max. :90.00
Max. :4.00
Weight HR Temp GCS
HCT BUN
Length:4000 Length:4000 Length:4000 Length:4000
Length:4000 Length:4000
Class :character Class :character Class :character Class :character
Class :character Class :character
Mode :character Mode :character Mode :character Mode :character
Mode :character Mode :character
Creatinine Platelets WBC Na
HCO3 K
Length:4000 Length:4000 Length:4000 Length:4000
Length:4000 Length:4000
Class :character Class :character Class :character Class :character
Class :character Class :character
Mode :character Mode :character Mode :character Mode :character
Mode :character Mode :character
Mg Glucose Urine Urine.Sum
NISysABP NIDiasABP
Length:4000 Length:4000 Length:4000 Length:4000
Length:4000 Length:4000
Class :character Class :character Class :character Class :character
Class :character Class :character
Mode :character Mode :character Mode :character Mode :character
Mode :character Mode :character
NIMAP pH PaCO2 PaO2
DiasABP SysABP
Length:4000 Length:4000 Length:4000 Length:4000
Length:4000 Length:4000
Class :character Class :character Class :character Class :character
Class :character Class :character
Mode :character Mode :character Mode :character Mode :character
Mode :character Mode :character
MAP FiO2 MechVent Lactate
SaO2 AST
Length:4000 Length:4000 Length:4000 Length:4000
Length:4000 Length:4000
Class :character Class :character Class :character Class :character
Class :character Class :character
Mode :character Mode :character Mode :character Mode :character
Mode :character Mode :character
ALT Bilirubin ALP Albumin
RespRate TroponinT
Length:4000 Length:4000 Length:4000 Length:4000
Length:4000 Length:4000
Class :character Class :character Class :character Class :character
Class :character Class :character
Mode :character Mode :character Mode :character Mode :character
Mode :character Mode :character
Cholesterol TroponinI
Length:4000 Length:4000
Class :character Class :character
Mode :character Mode :character
El 19 de junio de 2015, 16:10, Olivier Nuñez <onunez en unex.es> escribió:
> Mª Luz,
>
> si el comando de Carlos te devuelve 0 es que no hay NA's.
> Da igual que tus columnas sean caracteres o número.
> Lo que intuyo es que tienes celdas con la frase "NA" que interpretas como
> NA.
> Mandanos el summary de tu data.table y lo vemos...
>
> ----- Mensaje original -----
> De: "MªLuz Morales" <mlzmrls en gmail.com>
> Para: "Carlos J. Gil Bellosta" <cgb en datanalytics.com>
> CC: "r-help-es" <r-help-es en r-project.org>
> Enviados: Viernes, 19 de Junio 2015 16:02:58
> Asunto: Re: [R-es] Sobre data.table
>
> Hola,
>
> sapply(Datos, function(x) sum(is.na(x)))
>
> al aplicar esto me devuelve cero para todas las columnas, sin embargo si
> que hay elementos NA!!
>
> Un saludo
> MªLuz
>
> El 19 de junio de 2015, 15:06, Carlos J. Gil Bellosta <
> cgb en datanalytics.com>
> escribió:
>
> > Hola, ¿qué tal?
> >
> > ¿Y por qué no, simplemente, sapply(mi.data.table, function(x) sum(is.na
> > (x)))?
> >
> > Un saludo,
> >
> > Carlos J. Gil Bellosta
> > http://www.datanalytics.com
> >
> >
> >
> > El día 19 de junio de 2015, 14:44, Olivier Nuñez <onunez en unex.es>
> > escribió:
> > > Si te devuelve 0 para todas las columnas es que no hay NA's.
> > > Tal vez son caracteres igual a "NA".
> > > Para asegurarte de ello, prueba
> > >
> > > DT[,lapply(.SD,function(x) sum(x=="NA",na.rm=TRUE))]
> > >
> > >
> > >
> > > ----- Mensaje original -----
> > >
> > > De: "MªLuz Morales" <mlzmrls en gmail.com>
> > > Para: "Olivier Nuñez" <onunez en unex.es>
> > > CC: "r-help-es" <r-help-es en r-project.org>
> > > Enviados: Viernes, 19 de Junio 2015 14:17:46
> > > Asunto: Re: [R-es] Sobre data.table
> > >
> > > Uy pues con mi data.table no lo hace bien, me devuelve 0 para todas las
> > columnas. Podría ser porque algunas columnas son char y otras num??
> > >
> > > El 19 de junio de 2015, 13:03, Olivier Nuñez < onunez en unex.es >
> > escribió:
> > >
> > >
> > >
> > > Si quieres mantener el formato data.table en la salida, mejor utilizar
> > lapply:
> > >
> > >
> > >> DT[,lapply(.SD,function(x) sum( is.na (x)))]
> > > X1 X2
> > > 1: 2 3
> > >
> > >
> > >
> > > De: "MªLuz Morales" < mlzmrls en gmail.com >
> > > Para: "Olivier Nuñez" < onunez en unex.es >
> > > Enviados: Viernes, 19 de Junio 2015 12:40:09
> > > Asunto: Re: [R-es] Sobre data.table
> > >
> > > Muchas gracias!!
> > >
> > > El 19 de junio de 2015, 12:29, Olivier Nuñez < onunez en unex.es >
> > escribió:
> > >
> > > <blockquote>
> > >> DT=data.table(X1=c(NA,NA,1,1,1),X2=c(1,1,NA,NA,NA))
> > >> DT[,apply(.SD,2,function(x) sum( is.na (x)))]
> > > X1 X2
> > > 2 3
> > >
> > > Un saludo. Olivier
> > >
> > > ----- Mensaje original -----
> > > De: "MªLuz Morales" < mlzmrls en gmail.com >
> > > Para: "r-help-es" < r-help-es en r-project.org >
> > > Enviados: Viernes, 19 de Junio 2015 12:08:42
> > > Asunto: [R-es] Sobre data.table
> > >
> > > Hola,
> > >
> > > quisiera determinar el número de filas distintas del valor NA para cada
> > una
> > > de las columnas de un data.table. Probablemente se puede hacer de una
> > forma
> > > muy compacta, pero no consigo hacerlo.
> > >
> > > Gracias
> > > Un saludo
> > >
> > > MªLuz
> > >
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