[R-es] Knitr problema con xtable

[Rodrigo López Correa]

Hola soy medio nuevo en esto del uso del paquete knitr en R asociado a Lyx
y tengo el siguiente problema:

1) Construí un script en R que incluye entre otras operaciones simples una
tabla utilizando el paquete xtable para poder imprimirla luego con Lyx.


## @knitr q1

library(knitr)

library(RMySQL)

library(xtable)


#abro la base datos mysql

con <- dbConnect(MySQL(),

                 user="XXX", password="xxx",

                 dbname="hol", host="xxx")


uno<-dbGetQuery(con, "SELECT nhijl FROM resumen where leche;")

quantile(uno$nhijl,probs=(c(0.25,0.5)))

quantile(uno$nhijl,probs=0.5)

quantile(uno$nhijl,probs=0.75)

min(uno$nhijl)

max(uno$nhijl)


#tabla

tabla_uno<-data.frame(Total_hijas=round((c(min(uno$nhijl),quantile(uno$nhijl,probs=(0.25)),quantile(uno$nhijl,probs=0.5),
mean(uno$nhijl),quantile(uno$nhijl,probs=0.75),max(uno$nhijl)))))

rownames(tabla_uno)<-(c("Mínimo","1er.cuartil", "Mediana", "Media",
"3er.cuartil", "Máximo"))

print(xtable(tabla_uno),floating=FALSE)


2) Desde Lyx quise leer el script en R:

<<>>=

read_chunk("descriptiva_resumen.R")

@

<<q1,echo=TRUE,cache=FALSE,results="asis">>=

@

*Sin embargo, la exportación a un archivo pdf falla y probé las siguientes
2 opciones con resultados diferentes:*

3) Cuando elimino del chunk results="asis", puedo exportar a un pdf los
resultados esperados con el script de R, excepto la tabla que no la puedo
visualizar.

Entonces las 2 opciones que seguí fueron:

OPCION 3.1:

- Cerré el archivo pdf

- Luego volví a incluir results="asis" en el chunk original

- Finalmente traté de exportarlo a un *nuevo archivo pdf*.

Resultado: *Falló la exportación*

OPTION 3.2

*- Minimicé el archivo pdf* obtenido en el paso 3),

- Luego volví a incluir results="asis" en el chunk original

- Finalmente traté de *actualizar la salida del archivo pdf que había
minimizado.*


Resultado: *Obtuve el resultado correcto y completo de todo el script*


*No entiendo que estoy haciendo mal, porque debería poder obtener el
resultado de manera más directa incluyendo en el chunk original
results""asis"  y sin tener que hacer tantos pasos. *

Muchas gracias desde ya por cualquier ayuda!

Saludos,

Rodrigo.

-- 
*Dr. Rodrigo López Correa.*

Miguel Barreiro 3186.
Montevideo.
Uruguay.
Cel: 099 660 549.

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