[R-es] Comportamiento extraño de glm.nb

[Olivier Nuñez]

Bueno, es posible que los altos valores de tu respuesta (la media de Fobs es alrededor de 10000) y la escasez de datos validos (el 90% de los valores de Fobs son NA) hagan la vida dificil a glm.nb. Puedes probar ayudar glm.nb con valores de arranque razonables para este tipo de datos.

Prueba con
glm.nb(Fobs ~ Wnov, data=adults.dat, na.action="na.omit",link="identity",start=batch.glm$coef)

donde batch.glm es el ajuste con los datos "bien".
Un saludo. Olivier


----- Mensaje original -----
De: "Jorge Tornero - Listas" <jtorlistas en gmail.com>
Para: "r-help-es" <r-help-es en r-project.org>
Enviados: Jueves, 13 de Noviembre 2014 14:10:29
Asunto: [R-es] Comportamiento extraño de glm.nb

(Perdón, no puse asunto en el post original)

Ah, corremos R 3.0.2 y l alibrería MASS 7.3-29

Estimados todos:

Os escribo porque tengo un problema que nos está dejando un poco
trastornadillos. Probablemente sea uno de esos que los ve un experto a
un kilómetro y dice ¡oh! toca aquí. Pero nos trae de cabeza.

El caso es que aquí usamos un script para calcular ciertos parámetros
relacionados con el método de producción diaria de huevos del boquerón
del Golfo de Cádiz. Es un script que venimos usando desde hace tiempo
sin problema.

Pero ahora nos da un problema (línea 292) en :

batch.glm <- glm.nb(Fobs ~ Wnov, data=adults.dat,
na.action="na.omit",link="identity",start=0)

Error: no valid set of coefficients has been found: please supply
starting values
Además: Mensajes de aviso perdidos
In log(y/mu) : Se han producido NaNs

Aparte de que la documentación e información sobre el particular error
no es abundante, he aquí lo que nos desconcierta: Ese mismo script, con
datos similares (pero de otra campaña), corre perfectamente.

He probado a eliminar datos potencialmente conflictivos, pero nada. Los
archivos con los datos están generados exactamente de la misma manera
(salida de una base de datos postgresql, con idéntica consulta)

Se han revisado los datos y no aparece nada exótico. La verdad es que
estoy un poco desorientado, y por eso escribo a la lista.

He dejado una copia del script, así como de los datos, por si alguien se
animara a echar un vistazo en un gist en mi cuenta de github:

https://gist.github.com/734170b42c8307276451.git

Muchas gracias y un saludo

Jorge Tornero

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