[R-es] leer ficheros excel en R en Ubuntu

Vie Ago 15 16:20:24 CEST 2014

Miguel,

Me parece que el problema esta en rJava, intenta:

sudo apt-get install r-cran-rJava

Si te da error dinos que dice.

Suerte,

Daniel

El 15 de agosto de 2014, 10:46, "Marcuzzi, Javier Rubén" <
javier.ruben.marcuzzi en gmail.com> escribió:

> Estimado Miguel
>
> Entiendo su postura, una ayuda es desde el paquete Rcmdr, datos, importar,
> seleccionar el archivo xls y se escribe todo solo, lueogo puede copiar y
> pegar la parte del código relacionado a la importación, a un archivo R y
> listo, pero ..., creo que solo funciona correctamente en windows (tendría
> que intentarlo a la fecha de hoy).
>
> Javier Marcuzzi
>
>
> El 15/08/2014 04:29 a.m., Miguel Fiandor Gutiérrez escribió:
>
>> Hola,
>>
>> @javier, me gustaría no tener que hacer nada de forma manual, ni por fuera
>> de r, rstudio. Es decir, el típico comando de linux que me convierta de
>> xls
>> a csv prefiero no usarlo. Me gustaría hacerlo todo desde R.
>>
>> @jorge ->
>>
>> Con RODBC me salta ->
>>
>> Error: could not find function "odbcConnectExcel"
>>
>> Lo que creo que es inevitable en Ubuntu
>> <http://stackoverflow.com/questions/3426523/odbcconnectexcel-function-
>> from-rodbc-package-for-r-not-found-on-ubuntu>
>> Con gdata ->
>>
>> Unable to open file
>> '/home/miguelfg/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/gdata/
>> xls/madrid.xls'.Error
>> in xls2sep(xls, sheet, verbose = verbose, ..., method = method,  :
>>    Intermediate file '/tmp/RtmpHRuknw/filefed757fcc67.csv' missing!In
>> addition: Warning message:running command ''/usr/bin/perl'
>>
>> Con XLConnect ->
>>
>> Error : package ‘rJava’ was built before R 3.0.0: please re-install
>> itERROR: lazy loading failed for package ‘XLConnectJars’* removing
>> ‘/home/miguelfg/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/XLConnectJars’Warning
>> in install.packages :
>>    installation of package ‘XLConnectJars’ had non-zero exit
>> statusERROR: dependency ‘XLConnectJars’ is not available for package
>> ‘XLConnect’* removing
>> ‘/home/miguelfg/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/XLConnect’Warning in
>> install.packages :
>>    installation of package ‘XLConnect’ had non-zero exit status
>>
>> Con xlsReadWrite -> me dice que no está disponible para R 3.1.1 Con xlsx
>> ->
>>
>> Error : package ‘rJava’ was built before R 3.0.0: please re-install
>> itERROR: lazy loading failed for package ‘xlsxjars’* removing
>> ‘/home/miguelfg/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/xlsxjars’Warning in
>> install.packages :
>>    installation of package ‘xlsxjars’ had non-zero exit statusERROR:
>> dependency ‘xlsxjars’ is not available for package ‘xlsx’* removing
>> ‘/home/miguelfg/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/xlsx’Warning in
>> install.packages :
>>    installation of package ‘xlsx’ had non-zero exit status
>>
>> ================================= Viendo que el problema parecía java +
>> rJava, busqué y ejecuté -> sudo R CMD javareconf -e Pero parece que no
>> termina bien -> conftest.c:1:17: fatal error: jni.h: No such file or
>> directory compilation terminated. make: *** [conftest.o] Error 1 Unable to
>> compile a JNI program
>>
>>
>> El 15 de agosto de 2014, 2:23, Jorge I Velez <jorgeivanvelez en gmail.com>
>> escribió:
>>
>>  Hola Miguel,
>>>
>>> A que te refieres con "y nada"?  Obtienes algun error?  Algun mensaje?
>>>   Has probado con scan() y/o readLines()?
>>>
>>> Saludos,
>>> Jorge.-
>>>
>>>
>>>
>>> 2014-08-15 7:38 GMT+10:00 Miguel Fiandor Gutiérrez <
>>> miguel.fiandor.gutierrez en gmail.com>:
>>>
>>>  Hola,
>>>>
>>>> Pensé que esto iba a ser trivial en R, pero me estoy encontrado muchos
>>>> con
>>>> mi problema en internet, y que las soluciones ofrecidas no terminan de
>>>> funcionar.
>>>>
>>>> Estoy intentando leer un fichero .xls en ubuntu con los siguientes
>>>> paquetes
>>>> y nada:
>>>>
>>>> require(RODBC)
>>>> conn = odbcConnectExcel("madrid.xls") # open a connection to the Excel
>>>> file
>>>> sqlTables(conn)$TABLE_NAME # show all sheets
>>>> df = sqlFetch(conn, "Sheet1") # read a sheet
>>>> df = sqlQuery(conn, "select * from [Sheet1 $]") # read a sheet
>>>> (alternative
>>>> SQL sintax)
>>>> close(conn) # close the connection to the file
>>>>
>>>> require(gdata)
>>>> xlsfile <- file.path(path.package('gdata'),'xls','madrid.xls')
>>>> df = read.xls (xlsfile)
>>>> df = read.xls (xlsfile, sheet = 1, header = TRUE)
>>>> df = read.xls ("madrid.xls", sheet = 1, header = TRUE)
>>>> df = read.xls ("madrid.xls")
>>>>
>>>> require(xlsx)
>>>> read.xlsx("madrid.xls", sheetName = "Sheet1")
>>>>
>>>> library(XLConnect)
>>>> wk = loadWorkbook("madrid.xls")
>>>> df = readWorksheet(wk, sheet="Sheet1")
>>>>
>>>> --
>>>>
>>>> también he probado directamente read.table ya que el fichero es tipo xml
>>>> por dentro:
>>>> df = read.table("madrid.xls", header = TRUE)
>>>>
>>>>
>>>> -- ejemplo del fichero:
>>>> $ head -c 500 madrid.xls
>>>> <table border="1"><tr><th bgcolor="#FFB18C">Nombre de la
>>>> instalacion</th><th bgcolor="#FFB18C">Municipio de la
>>>> instalacion</th><th
>>>> bgcolor="#FFB18C">Provincia de la instalacion</th><th
>>>> bgcolor="#FFB18C">Clave del registro</th><th bgcolor="#FFB18C">Codigo
>>>> registro autonomico definitivo</th><th bgcolor="#FFB18C">Potencia
>>>> nominal
>>>> de la fase (kW)</th><th bgcolor="#FFB18C">Grupo Normativo</th><th
>>>> bgcolor="#FFB18C">Tipo de Inscripcion</th></tr><tr><td>PERGOLA
>>>> FOTOVOLTAICA
>>>> JARDINES COMPLEJO DE MONCLOA
>>>> ...
>>>>
>>>>
>>>> Gracias de antemano.
>>>>
>>>> Por cierto, aprovecho que lanzo la pregunta es para una aplicación
>>>> Shiny,
>>>> alguna recomendación de como leer esta info solo una vez al arrancar el
>>>> servidor?
>>>>
>>>>
>>>> Miguel
>>>>
>>>>          [[alternative HTML version deleted]]
>>>>
>>>> _______________________________________________
>>>> R-help-es mailing list
>>>> R-help-es en r-project.org
>>>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
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>>>>
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>

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Daniel

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