[R-es] R y had non-zero exit status

[Jose Luis Cañadas Reche]

Como dice José normalmente son las cabeceras, (terminando en dev) . Para 
gtk prueba con

sudo apt-get install libgtk2.0-dev

Yo también estoy en ubuntu 13.10 y precisamente me pasó algo similar al 
instalar rgl, lo solucioné instalando libglu1-mesa-dev y algunas otras 
"dev".

Saludos

El 05/11/13 17:50, Carlos J. Gil Bellosta escribió:
> Hola, ¿qué tal?
>
> Eso te dice que es probable que te falte el paquete gtk+2.0 de ubuntu:
> prueba a hacer
>
> sudo apt-get install gtk-2.0
>
> y luego trata de instalar el paquete de R de nuevo. Es posible que
> vuelvas a tener algún tipo de dependencia insatisfecha y tengas que
> volver a repetir el proceso: identificar el paquete faltante
> (típicamente, una librería), instalarlo con apt-get y volver a tratar
> de instalar el paquete. Desafortunadamente, no es posible alinear las
> dependencias de R y del sistema operativo (salvo para los paquetes de
> R distribuidos como .deb directamente desde repositorios Ubuntu).
>
> Un saludo,
>
> Carlos J. Gil Bellosta
> http://www.datanalytics.com
>
> El día 5 de noviembre de 2013 17:36, "Marcuzzi, Javier Rubén"
> <javier.ruben.marcuzzi en gmail.com> escribió:
>> Estimados Carlos y José
>>
>> Efectivamente deben ser librerías que faltan, desde RStudio para ratlle el
>> error de xml desapareció al utilizar los repositorios de cran en ubuntu,
>> como si instalaría cualquier programa.
>>
>> Hay otro error que aún no intenté solucionar, que es desde RStudio (aunque
>> creo que instale algo de gtk ...), es el siguiente:
>>
>>> rattle()
>> Installing package into ‘/home/javier/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0’
>> (as ‘lib’ is unspecified)
>> probando la URL
>> 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/cairoDevice_2.19.tar.gz'
>> Content type 'application/x-gzip' length 39787 bytes (38 Kb)
>> URL abierta
>> ==================================================
>> downloaded 38 Kb
>>
>> * installing *source* package ‘cairoDevice’ ...
>> ** package ‘cairoDevice’ successfully unpacked and MD5 sums checked
>> checking for pkg-config... pkg-config
>> ERROR: gtk+2.0 not found by pkg-config.
>> ERROR: configuration failed for package ‘cairoDevice’
>> * removing ‘/home/javier/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/cairoDevice’
>> Warning in install.packages :
>> installation of package ‘cairoDevice’ had non-zero exit status
>>
>> The downloaded source packages are in
>> ‘/tmp/Rtmpp1rozz/downloaded_packages’
>>
>> Personalmente pienso que si instalo desde los repositorios ubuntu tengo que
>> esperar la actualización de estos, los cuáles estarían obsoletos en
>> comparación con los repositorios de R, (repositorios ubuntu para R vs
>> repositorios R), o estoy equivocado.
>>
>> También hay un error de ese tipo con tm... (text mining . *).
>>
>> ¿Que es lo conveniente?
>>
>> Javier Marcuzzi
>> El 05/11/13 12:47, Carlos J. Gil Bellosta escribió:
>>
>>> Hola, ¿qué tal?
>>>
>>> Abundando en lo que indica José, deberías hacernos llegar la lista
>>> completa de mensajes que se generan durante la instalación.
>>> Típicamente, antes del "had non-zero exit status" encontrarás mensajes
>>> del tipo "checking for... FALSE" y otros que te dan pistas sobre lo
>>> que te falta por instalar.
>>>
>>> Un saludo,
>>>
>>> Carlos J. Gil Bellosta
>>> http://www.datanalytics.com
>>>
>>> El día 5 de noviembre de 2013 16:39, José Trujillo Carmona
>>> <trujillo en unex.es> escribió:
>>>> Normalmente hay alguna dependencia incumplida.
>>>>
>>>> Antes del had hay una indicación del paquete o función que necesita. Si
>>>> es
>>>> un paquete lo instala con Synaptic o apt-get. Si es una función, hay que
>>>> saber en qué paquete se encuentra.
>>>>
>>>> Normalmente en Google se encuentra el paquete al que pertenece la
>>>> función.
>>>>
>>>> No es seguro, hay veces que no.
>>>>
>>>> A menudo son los paquetes -dev (desarrollo) de librerías ya instaladas
>>>> los
>>>> que se necesitan que aporten librerias para la compilación.
>>>>
>>>> Suerte.
>>>>
>>>>
>>>> El 05/11/13 16:17, "Marcuzzi, Javier Rubén" escribió:
>>>>
>>>>> Hola a todos
>>>>>
>>>>> Estoy utilizando linux ubuntu 13.10, hace mucho que no utilizo este
>>>>> sistema.
>>>>>
>>>>> R y Rstudio se instalaron sin problemas, desde Rstudio instalo las
>>>>> librerías que necesito, pero en algunas aparece el mensaje had
>>>>> non-zero exit status, por ejemplo xml, desde los repositorios de
>>>>> ubuntu cran-xml (no recuerdo este en detalle) dicha librería está
>>>>> disponible y la instale desde este, pero por ejemplo rattle busca lo
>>>>> que necesita, lo instala, pero como hay un error de ...had non-zero
>>>>> exit status... no se instala como debería ser (el proceso finaliza).
>>>>>
>>>>> ¿Los que utilizan ubuntu, como hacen en estos casos?
>>>>>
>>>>> Desde ya muchas gracias
>>>>> Javier Marcuzzi
>>>>>
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