[R-es] Unir varias columnas en una sola
Marcuzzi, Javier Ruben
javier.ruben.marcuzzi en gmail.com
Dom Feb 24 04:20:26 CET 2013
Estimado Fernando Macedo
Ha, entonces si es SNP, genética ..., de eso entiendo, bueno, son las
00.17 hs y tengo sueño, mis neuronas ...
Sin dudas hay gente mucho más capacitada que yo, pero si me lo permite
puede "salir de R", aunque no es exactamente eso, solamente cambiar
r-project por http://www.bioconductor.org/
Posiblemente hay alguna solución que se adapta a sus requerimientos.
Javier Marcuzzi
On vie, 2013-02-22 at 19:39 -0200, Fernando Macedo wrote:
> Hola Javier, disculpa no contestarte antes pero se me paso tu
> pregunta.
>
>
> Si sin columnas de igual longitud. es para trabajar con resultados de
> SNPs, donde cara columna tiene el resultado para cada SNP y este puede
> ser solamente 0, 1 o 2 copias del alelo.
>
>
> Gracias por tu aporte sobre el sqldf no lo había pensado.
>
>
> Saludos
>
>
> Fernando
>
>
>
> El 18 de febrero de 2013 00:47, Marcuzzi, Javier
> <javier.ruben.marcuzzi en gmail.com> escribió:
> Estimado Fernando Macedo
>
> Creo que las ayudas que le dieron pueden ser muy eficientes,
> también se
> podría decir utilizar sql (sqldf ...), pero posiblemente los
> comentarios
> aportados por los otros participantes de la lista son más
> apropiados.
>
> Sin embargo, me crea una duda, ¿sus columnas son todas de la
> misma
> longitud?, pienso que con el ID no hay problema, pero luego,
> el resto de
> las columnas que son concatenadas a una sola, ¿como separa la
> información? Por ejemplo, si todas las columnas tienen 20
> dígitos es
> fácil, pero ¿si solo un valor en una columna tiene 19 dígitos?
>
> Javier Marcuzzi
>
> El sáb, 16-02-2013 a las 19:12 -0200, Fernando Macedo
> escribió:
> > Eso, por ahí es el asunto, tengo que estudiar más el comando
> apply, o
> > mejorar mi creatividad.
> >
> > Saludos y muchas gracias!!!
> >
> > Fernando
> >
> >
> > El 16/02/13 19:06, Carlos J. Gil Bellosta escribió:
> > > data(iris)
> > > apply(iris[,-1], 1, paste, collapse = " ")
> > >
> > > Un saludo,
> > >
> > > Carlos J. Gil Bellosta
> > > http://www.datanalytics.com
> > >
> > > El día 16 de febrero de 2013 22:01, Fernando Macedo
> > > <fermace en gmail.com> escribió:
> > >> Muchas gracias Carlos, esta puede ser una manera, pero
> omití decir que
> > >> tengo que juntar en principio 90 columnas y luego podrían
> ser unas
> > >> bastantes más, con lo que escribir cada columna por
> separado en el
> > >> comando paste() resulta poco práctico.
> > >>
> > >> Estuve tratando de usar colnames embutido en el paste o
> > >> dat[,2:ncol(dat)] pero no obtengo lo que busco. ¿Alguna
> otra idea de
> > >> como poder usar el paste?
> > >>
> > >> Puedo separa la parte del ID y los datos y trabajarlas
> por separado para
> > >> luego juntarlas, pero estoy en la misma al momento de
> juntar los datos
> > >> en un bloque solo.
> > >>
> > >> Saludos
> > >>
> > >> Fernando
> > >>
> > >>
> > >> El 16/02/13 18:08, Carlos Ortega escribió:
> > >>> Hola,
> > >>>
> > >>> Esta es una forma:
> > >>>
> > >>>> dat <- data.frame(ID=1:10, col2=rnorm(10),
> col3=rnorm(10),
> > >>> col4=rnorm(10))
> > >>>> dat
> > >>> ID col2 col3 col4
> > >>> 1 1 1.937262274 -1.40273857 -1.9050536
> > >>> 2 2 1.337924391 1.22860925 0.3107429
> > >>> 3 3 -0.002105218 -1.23291681 -0.8310097
> > >>> 4 4 0.058295336 1.61871970 -1.0597558
> > >>> 5 5 -0.091517513 -0.99422029 0.6173428
> > >>> 6 6 0.534795503 0.07014697 2.0995122
> > >>> 7 7 -0.075998477 -0.23940158 -1.0736795
> > >>> 8 8 -0.886673525 0.10413987 0.5884510
> > >>> 9 9 1.710306972 1.82942633 0.8287779
> > >>> 10 10 -0.208130660 0.30641105 -0.1400882
> > >>>> paste(dat$ID," ", dat$col2, dat$col3, dat$col4, sep="")
> > >>> [1] "1
> 1.93726227410434-1.40273857014605-1.90505356394495"
> > >>> [2] "2
> 1.337924391475771.228609247659310.31074290333037"
> > >>> [3] "3
> -0.00210521831655121-1.23291680520637-0.831009714534192"
> > >>> [4] "4
> 0.05829533559436561.61871969701435-1.05975581471527"
> > >>> [5] "5
> -0.0915175127220064-0.9942202875567060.617342803251114"
> > >>> [6] "6
> 0.534795503353260.0701469747674812.09951220785224"
> > >>> [7] "7
> -0.0759984771691605-0.239401578046576-1.07367948585017"
> > >>> [8] "8
> -0.8866735246857180.1041398738270440.588451006124745"
> > >>> [9] "9
> 1.710306971765611.829426334369970.828777900768105"
> > >>> [10] "10
> -0.2081306604078980.306411045612295-0.140088249050132"
> > >>>
> > >>>
> > >>> Saludos,
> > >>> Carlos Ortega
> > >>> www.qualityexcellence.es
> <http://www.qualityexcellence.es>
> > >>>
> > >>>
> > >>> El 16 de febrero de 2013 19:58, Fernando Macedo
> <fermace en gmail.com
> > >>> <mailto:fermace en gmail.com>> escribió:
> > >>>
> > >>>
> > >>>
> > >>> Buenas a todos, relato directamente mi problema.
> > >>>
> > >>> Estoy preparando unos datos para ingresarlos en
> otro programa que
> > >>> requiere una columna de ID y el resto de la
> información toda
> > >>> seguida sin
> > >>> espacios.
> > >>>
> > >>> El echo es que yo tengo la información separada en
> columnas, por
> > >>> ejemplo:
> > >>>
> > >>> ID col2 col3 col4 col5 etc.
> > >>>
> > >>> y precisaría dejarla de la siguiente forma:
> > >>>
> > >>> ID col2col3col4col5 etc.
> > >>>
> > >>> Para luego escribir a disco y proceder con otro
> software.
> > >>>
> > >>> Alguien sabe que comando puedo usar para juntar una
> serie columnas
> > >>> todas
> > >>> en un bloque solo?
> > >>>
> > >>> Saludos y muchas gracias de ante mano!!
> > >>>
> > >>> Fernando Macedo
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