[R-es] Grafico de medias con barra de desviacion para varias series de datos

[Eric]

Hola Carlos, este es el codigo que tengo para lattice y me produce el
grafico que adjunto, adjunto tb un nuevo archivo de datos, ya que he medido
un poco mas y se va agregando informacion ... estoy leyendo la ayuda de xYplot
{Hmisc} para agregar las barras de dispersion y reemplazar el conjunto de
datos de cada punto en X por su correspondiente promedio. En la imagen
adjunta, primero se agruparon los datos por tipo de solvente: ss=sin
solvente (q es un control), lim=limoneno, dec=decanol, dentro de cada
grafico los datos estan agrupados por concentracion desde 1 a 5, cada color
representa una concentracion distinta, en el eje X se presenta la cantidad
de dias que se cultiva la microalga y en el eje Y se muestra la absorbancia
asociada.

el codigo:

library(lattice)
setwd("/home/neo/Dropbox/Tesis/4tesis/2.objesp/experimento/cultivo")
curcre <- read.table("curvadecrecimientobraunii2.csv",
header=TRUE,sep="\t",dec=".",as.is=FALSE,na.strings = "NA",skip=0)
xyplot(curcre[,6]~curcre[,2]|factor(solv),groups=con,data=curcre,xlab="dias",ylab="Abs")
savePlot(filename = "grafico",type ="png",device = dev.cur())




Saludos, eric.





2012/9/24 Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>

> Hola,
>
> Gracias por aportar el conjunto de datos con los que poder probar.
> ¿Tienes el código que has hecho en lattice ?. De esta forma es más fácil
> que tener que probar con varias opciones de modelos que tengan las
> variables que quieres monitorizar.
>
> En el mientras tanto como alternativa podrías mirar:
>
>    -  la función xYplot() del paquete Hmisc.
>    - el utilizar la opción de incluir una capa (layer) sobre tu gráfico
>    lattice donde incluyas las medias y las desvicaciones. Aquí tendrás que
>    usar el paquete latticeExtra y varias de sus funciones: layer(),
>    panel.abelineq()
>
>
> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>
> El 23 de septiembre de 2012 16:18, Eric <ericconchamunoz en gmail.com>escribió:
>
>> Estimada comunidad, tengo el siguiente problema:
>>
>> Estoy haciendo un experimento de toxicidad de solventes para microalgas,
>> por ahora tengo los datos de un solvente en 5 diferentes concentraciones y
>> un control, cada unidad experimental tiene 3 repeticiones, y necesito
>> graficar las curvas de crecimiento del cultivo de algas. Tendria 6 curvas
>> de crecimiento. Puse los datos en la tabla que adjunto como archivo .csv.
>> La primera columna corresponde a los dias de crecimiento del alga y deberia
>> ir en el eje X, la segunda columna indica la repeticion, la tercera columna
>> indica el tipo de solvente usado ss=sin solvente y lim=limoneno, la columna
>> con indica la concentracion del solvente y va de 1 a 5, la columna ABS es
>> la medicion que se hizo e indica la absorbancia de la muestra.
>>
>>  He intentado con PlotMeans y lattice pero no logro obtener el grafico
>> que deseo. Es como si fuera necesario fundir esos dos paquetes para obtener
>> loque necesito, ya que PlotMeans me permite graficar las medias con las
>> barras de desviacion, pero no permite (al menos no he encontrado como)
>> clasificar o diferenciar las concentraciones, por su lado con lattice puedo
>> diferenciar las concentraciones pero no puedo graficar el promedio con las
>> barras de desviacion (al menos no se como hacerlo) ... este es mi problema,
>> alguna sugerencia ??
>>
>> Un abrazo a todos y gracias por su tiempo.
>>
>> Eric.
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>> --
>> Nota: las tildes se han omitido para evitar conflictos con algunos
>> lectores de correo.
>>
>> Frases notables:
>> * SATYÂT NÂSTI PARO DHARMAH (No hay religion mas elevada que la verdad)
>> * La oscuridad no se combate, se ilumina ...
>> * Un economista es un experto que sabrá mañana por qué las cosas que
>> predijo
>> ayer no han sucedido hoy (Laurence Peter).
>>
>>
>> _______________________________________________
>> R-help-es mailing list
>> R-help-es en r-project.org
>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>
>>
>
>
> --
> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>



-- 
Nota: las tildes se han omitido para evitar conflictos con algunos lectores
de correo.

Frases notables:
* SATYÂT NÂSTI PARO DHARMAH (No hay religion mas elevada que la verdad)
* La oscuridad no se combate, se ilumina ...
* Un economista es un experto que sabrá mañana por qué las cosas que predijo
ayer no han sucedido hoy (Laurence Peter).
------------ próxima parte ------------
Se ha borrado un adjunto en formato HTML...
URL: <https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20120927/ec670cd0/attachment-0001.html>
------------ próxima parte ------------
A non-text attachment was scrubbed...
Name: grafico
Type: application/octet-stream
Size: 31566 bytes
Desc: no disponible
URL: <https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20120927/ec670cd0/attachment-0001.obj>
------------ próxima parte ------------
A non-text attachment was scrubbed...
Name: curvadecrecimientobraunii2.csv
Type: text/csv
Size: 4346 bytes
Desc: no disponible
URL: <https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20120927/ec670cd0/attachment-0001.bin>