[R-es] R, knitr y markdown . ¿Cómo insertar tabla de contenidos en documento markdown?

[José Luis Cañadas]

Gracias a todos por la ayuda.

Al final lo he hecho utilizando los  paquetes knitr y markdown . Primero 
paso el documento Rmd a md con

knit("fichero.Rmd", "fichero.md")

Y luego paso el fichero md generado a html con

markdownToHTML(file="fichero.md",options='toc',output="salida.html")

Ahora me falta aprender sobre html , para crear una barra de navegación 
con enlaces a las distintas cabeceras del documento, y utilizar/crear 
algún css para modificar aspecto de tablas y demás..

Saludos.