[R-es] Instalar la version 2.14.0 de R

[Jose Luis Cañadas]

Eric
En http://debian-r.debian.net/ indica como instalar un repositorio en 
debian para R, sustituyendo a cran2deb. Hay varios paquetes de 
bioconductor, a ver si tienes suerte. Yo he probado y he podido 
instalarlo, pero al cargarlo en R 2.15.0 con library(flowCore) me dice 
lo siguiente:

 > library(flowCore)
Loading required package: Biobase

Welcome to Bioconductor

   Vignettes contain introductory material. To view, type
   'browseVignettes()'. To cite Bioconductor, see
   'citation("Biobase")' and for packages 'citation("pkgname")'.

Loading required package: rrcov
Loading required package: robustbase
Loading required package: pcaPP
Loading required package: mvtnorm
Scalable Robust Estimators with High Breakdown Point (version 1.3-01)
Error : Function found when exporting methods from the namespace 
‘flowCore’ which is not S4 generic: ‘plot’
Además: Mensajes de aviso perdidos
replacing previous import ‘.__C__character’ when loading ‘methods’
Error: package/namespace load failed for ‘flowCore’

A ver si tú tienes más suerte...



El 10/05/12 15:37, Marcuzzi, Javier Rubén escribió:
> Eric
>
> Hace un tiempo que no utilizo linux, y mis últimas experiencias con
> ubuntu no fueron lo placenteras de las primeras, ¿que posibilidad hay de
> utilizar repositorios debian?, puede ser que la falta de esa librería se
> solucione.
>
> Javier
>
> -----Mensaje original----- From: Eric
> Sent: Thursday, May 10, 2012 10:30 AM
> To: Freddy López
> Cc: r-help-es en r-project.org
> Subject: Re: [R-es] Instalar la version 2.14.0 de R
>
> hola freddy, acabo de indicarlo en respuesta a una sugrencia de javier ...
> el error dice:
>
> checking X11/Intrinsic.h usability... no
> checking X11/Intrinsic.h presence... no
> checking for X11/Intrinsic.h... no
> configure: error: --with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not
> available
>
>
> slds.
>
>
>
>
>
>
> 2012/5/10 Freddy López <freddy.vate01 en gmail.com>
>
>> Hola.
>>
>> Quizá sería útil que fueras un poco más específico: ¿podrías decirnos por
>> ejemplo cuáles son esas dependencias que no acaban de instalar?
>>
>> Saludos
>>
>>
>> 2012/5/10 Eric <ericconchamunoz en gmail.com>
>>
>>> Estimada comunidad, este no es un problema de matematica-estadistica a
>>> resolver con R, ni de R ... el problema es el siguiente: cambie laptop e
>>> instale hace tiempo ya la version de ubuntu 12.04 con R 2.14.1 que trae
>>> por
>>> defecto ... el problema es que unos paquetes de Bioconductor
>>> (flowCore por
>>> ejemplo) no corren con una versión posterior a la 2.14.0 ... y
>>> desconozco
>>> la forma de instalar 2.14.0 ... lo que hice:
>>>
>>> 1. desinstales 2.14.1
>>> 2. baje las fuentes de 2.14.0 y trate de compiar e instalar pero
>>> falla la
>>> compilacion por problemas de dependencias que no acaban nunca, cuando
>>> instalo algo que faltaba ahora falta otra cosa (raro con distro
>>> basada en
>>> debian, pero asi es)
>>>
>>> en resumen no funciono ...
>>>
>>> ahora estoy intentando con apt-pinning para que instale la version de
>>> R de
>>> la pasada version de ubuntu (si es que una version antigua de ubuntu
>>> significa tambien una version antigua de R) pero tambien va con algunos
>>> problemas y no logro tener R funcionando
>>>
>>> obviamente la pregunta es si alguien sabe como instalar la version
>>> 2.14.0
>>> de R de forma simple en ubuntu 12.04
>>>
>>> Saludos a todos,
>>>
>>> eric.
>>>
>>>
>>>
>>>
>>>
>>>
>>>
>>> --
>>> Nota: las tildes se han omitido para evitar conflictos con algunos
>>> lectores
>>> de correo.
>>>
>>> * Un economista es un experto que sabrá mañana por qué las cosas que
>>> predijo
>>> ayer no han sucedido hoy (Laurence Peter).
>>>
>>> * SATYÂT NÂSTI PARO DHARMAH
>>>
>>> [[alternative HTML version deleted]]
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