[R-es] Sobre survival analysis
Marcuzzi, Javier Rubén
javier.ruben.marcuzzi en gmail.com
Vie Jun 29 16:24:44 CEST 2012
Eric Flores De Gracia
Entiendo su duda, pero no se la respuesta, posiblemente en un libro o
internet alguien describa con algún ejemplo las diferencias entre ambas
alternativas de R.
Disculpe, en este momento no puedo consultar en mi bibliografía.
Estoy actualizando R en mi computadora, hay varios paquetes que tienen
información al respecto, los que tengo hoy bajo ??strata son
base::scoping An illustration of lexical scoping. (Run demo in
console)
epicalc::Epicalc.features Demonstration of various features of
Epicalc (Run demo in console)
rgl::rgl RGL Demonstration (Run demo in console)
Help pages:
agridat::digby.jointregression Multi-environment trial illustrating
joint regression
foreign::read.dta Read Stata Binary Files
foreign::write.dta Write Files in Stata Binary Format
ggplot2::ggmissing Create a plot to illustrate patterns of missing
values.
ggplot2::should_stop Used in examples to illustrate when errors
should occur.
Hmisc::stata.get Enhanced Importing of STATA Files
Hmisc::summarize Summarize Scalars or Matrices by
Cross-Classification
Hmisc::summary.formula Summarize Data for Making Tables and Plots
Hmisc::xy.group Mean x vs. function of y in groups of x
MASS::VA Veteran's Administration Lung Cancer Trial
Rcmdr::Rcmdr.Utilities Rcmdr Utility Functions
stats::eff.aovlist Compute Efficiencies of Multistratum Analysis of
Variance
stats::NLSstRtAsymptote Horizontal Asymptote on the Right Side
survival::strata Identify Stratification Variables
survival::veteran Veterans' Administration Lung Cancer study
utils::demo Demonstrations of R Functionality
Javier Marcuzzi
-----Mensaje original-----
From: Flores-de-Gracia, Eric
Sent: Friday, June 29, 2012 9:53 AM
To: Marcuzzi, Javier Rubén ; r-help-es en r-project.org
Subject: RE: [R-es] Sobre survival analysis
Gracias Javier
Quizas el problema es que no estoy familiarizado con el Cox regression, y la
verdad ambos resultados son significativos pero no sabría como interpretar.
Por ejemplo strata agrupa los efectos en cierta forma osea que la
comparación se hace por agrupación?
Mientras que incluyendo el término block como otra variable independiente en
el análisis implica que ambos factores (size y block) interactuan en la
respuesta o simplemente son efectos aislados entonces mejor verifico los
efectos de cada uno por separado, es decir un modelo para size y uno para
block?
Gracias
Eric Flores De Gracia
School of Biosciences
University of Exeter, Cornwall Campus
Penryn, Cornwall
TR10 9EZ
United Kingdom
Mobilephone: +044 07578724705
http://biosciences.exeter.ac.uk/cec/staff/postgradresearch/index.php?web_id=Eric_Flores_de_Gracia&tab=profile
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De: Marcuzzi, Javier Rubén [javier.ruben.marcuzzi en gmail.com]
Enviado el: jueves, 28 de junio de 2012 20:11
Para: Flores-de-Gracia, Eric; r-help-es en r-project.org
Asunto: Re: [R-es] Sobre survival analysis
Eric Flores De Gracia
Que pasa si copia y pega el siguiente código en R, ¿le ayuda esto?
coxph(Surv(futime, fustat) ~ age + strata(rx), data=ovarian)
coxph(Surv(futime, fustat) ~ age + rx, data=ovarian)
summary(coxph(Surv(futime, fustat) ~ age + strata(rx), data=ovarian))
summary(coxph(Surv(futime, fustat) ~ age + rx, data=ovarian))
Javier Marcuzzi
-----Mensaje original-----
From: Flores-de-Gracia, Eric
Sent: Thursday, June 28, 2012 10:35 AM
To: r-help-es en r-project.org
Subject: [R-es] Sobre survival analysis
Hola
Estoy tratando de correr un survival analysis usando un Cox regression
model.
Tengo una duda respecto a la organizacion del script. Tengo una variable que
es -tamano del individuo- y quiero ver si hay diferencia en sobrevivencia
respecto a tamano. Como diseno de campo los tamanos fueron ubicados de forma
aleatoria en bloques al azar.
Cuado planteo el script tengo algo como:
modelo<-coxp(surv(deaths,day)~size+strata(block))
El factor bloque es random pero no se si esta es la nomenclatura correcta
para testar mi hipotesis, o simplemente debo omitir el termino -strata-
Gracias,saludos
Eric Flores De Gracia
School of Biosciences
University of Exeter, Cornwall Campus
Penryn, Cornwall
TR10 9EZ
United Kingdom
Mobilephone: +044 07578724705
http://biosciences.exeter.ac.uk/cec/staff/postgradresearch/index.php?web_id=Eric_Flores_de_Gracia&tab=profile
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