[BioC] Rgraphviz intall error

[Nolwenn Le Meur]

Hi,I'm trying to install Rgraphviz (on Linux redHat 9.0) but I go further
that this:

PS: I also tried by downloading the .tgz but same message.

Any idea what I'm missing ?
Thanks
Nolwenn

1] "Attempting to download Rgraphviz from
http://www.bioconductor.org/repository/release1.4/package/Source"
[1] "Download complete."
[1] "Installing Rgraphviz"
* Installing *source* package 'Rgraphviz' ...
** libs
gcc -I/usr/lib/R_HOME/include
dotneato-config --cflags`  -I/usr/local/include -D__NO_MATH_INLINES -mieee-f
p -Wall -fPIC  -g -O2 -c Rgraphviz.c -o Rgraphviz.o
Dans le fichier inclus à partir de Rgraphviz.c:1:
common.h:21:20: render.h: Aucun fichier ou répertoire de ce type
common.h:22:19: graph.h: Aucun fichier ou répertoire de ce type
common.h:23:22: dotprocs.h: Aucun fichier ou répertoire de ce type
common.h:24:24: neatoprocs.h: Aucun fichier ou répertoire de ce type
common.h:25:20: adjust.h: Aucun fichier ou répertoire de ce type
common.h:27:22: gvrender.h: Aucun fichier ou répertoire de ce type
Dans le fichier inclus à partir de Rgraphviz.c:1:
common.h:29: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:29: AVERTISSEMENT: type utilisé par défaut « int» dans la
déclaration de « gvc  »
common.h:29: AVERTISSEMENT: définition de données n'a pas de type ou de
classe de stockage
common.h:46: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:47: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:51: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:52: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:55: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:55: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:55: AVERTISSEMENT: type utilisé par défaut « int» dans la
déclaration de « dotLayout  »
common.h:55: AVERTISSEMENT: définition de données n'a pas de type ou de
classe de stockage
common.h:56: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:56: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:56: AVERTISSEMENT: type utilisé par défaut « int» dans la
déclaration de « neatoLayout  »
common.h:56: AVERTISSEMENT: définition de données n'a pas de type ou de
classe de stockage
common.h:57: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:57: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:57: AVERTISSEMENT: type utilisé par défaut « int» dans la
déclaration de « twopiLayout  »
common.h:57: AVERTISSEMENT: définition de données n'a pas de type ou de
classe de stockage
common.h:58: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:58: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
common.h:58: AVERTISSEMENT: type utilisé par défaut « int» dans la
déclaration de « setDefaultAttrs  »
common.h:58: AVERTISSEMENT: définition de données n'a pas de type ou de
classe de stockage
Rgraphviz.c:2:20: circle.h: Aucun fichier ou répertoire de ce type
Rgraphviz.c: Dans la fonction « Rgraphviz_init »:
Rgraphviz.c:79: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agseterr »
Rgraphviz.c:79: « AGERR » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:79: (Chaque identificateur non déclaré est rapporté une seule
fois
Rgraphviz.c:79: pour chaque fonction dans laquelle il apparaît.)
Rgraphviz.c:81: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
gvNEWcontext »
Rgraphviz.c:81: AVERTISSEMENT: affectation transforme en pointeur un entier
sans transtypage
Rgraphviz.c: Dans la fonction « Rgraphviz_fin »:
Rgraphviz.c:88: « Agraph_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:88: « g » non déclaré (première utilisation dans cette fonction)
Rgraphviz.c:92: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agclose »
Rgraphviz.c: Dans la fonction « Rgraphviz_agread »:
Rgraphviz.c:99: « Agraph_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:99: « g » non déclaré (première utilisation dans cette fonction)
Rgraphviz.c:106: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
aginit »
Rgraphviz.c:107: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agread »
Rgraphviz.c: Dans la fonction « Rgraphviz_agwrite »:
Rgraphviz.c:113: « Agraph_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:113: « g » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:127: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agwrite »
Rgraphviz.c: Dans la fonction « Rgraphviz_agopen »:
Rgraphviz.c:138: « Agraph_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:138: « g » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:138: « tmpGraph » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:138: AVERTISSEMENT: l'opérande à gauche de la virgule dans
l'expression n'a pas d'effet
Rgraphviz.c:139: « sgs » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:140: « Agnode_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:140: « head » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:140: « tail » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:140: « tmp » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:140: AVERTISSEMENT: l'opérande à gauche de la virgule dans
l'expression n'a pas d'effet
Rgraphviz.c:140: AVERTISSEMENT: l'opérande à gauche de la virgule dans
l'expression n'a pas d'effet
Rgraphviz.c:141: « Agedge_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:141: « curEdge » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:164: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agopen »
Rgraphviz.c:167: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « ) »
Rgraphviz.c:174: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agsubg »
Rgraphviz.c:197: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agnode »
Rgraphviz.c:203: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agset »
Rgraphviz.c:222: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agfindnode »
Rgraphviz.c:232: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agedge »
Rgraphviz.c:243: requête pour le membre « g » dans quelque chose qui n'est
pas une structure ou un union
Rgraphviz.c:244: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
GD_gvc »
Rgraphviz.c:244: invalid lvalue in assignment
Rgraphviz.c: Dans la fonction « Rgraphviz_getAttr »:
Rgraphviz.c:250: « Agraph_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:250: « g » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:258: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agget »
Rgraphviz.c:258: AVERTISSEMENT: passage de arg 1 de « R_scalarString »
transforme en pointeur un entier sans transtypage
Rgraphviz.c: Dans la fonction « Rgraphviz_doLayout »:
Rgraphviz.c:264: « Agraph_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:264: « g » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:285: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
dot_layout »
Rgraphviz.c:288: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
neato_layout »
Rgraphviz.c:291: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
twopi_layout »
Rgraphviz.c: Au niveau supérieur:
Rgraphviz.c:316: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
Rgraphviz.c: Dans la fonction « buildRagraph »:
Rgraphviz.c:320: « g » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:328: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agnedges »
Rgraphviz.c: Au niveau supérieur:
Rgraphviz.c:336: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
Rgraphviz.c: Dans la fonction « getBoundBox »:
Rgraphviz.c:348: « g » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c: Au niveau supérieur:
Rgraphviz.c:360: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
Rgraphviz.c: Dans la fonction « getNodeLayouts »:
Rgraphviz.c:361: « Agnode_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:361: « node » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:367: « g » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:379: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agnnodes »
Rgraphviz.c:380: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agfstnode »
Rgraphviz.c:396: AVERTISSEMENT: passage de arg 1 de « R_scalarString »
transforme en pointeur un entier sans transtypage
Rgraphviz.c:398: AVERTISSEMENT: passage de arg 1 de « R_scalarString »
transforme en pointeur un entier sans transtypage
Rgraphviz.c:400: AVERTISSEMENT: passage de arg 1 de « R_scalarString »
transforme en pointeur un entier sans transtypage
Rgraphviz.c:402: AVERTISSEMENT: passage de arg 1 de « R_scalarString »
transforme en pointeur un entier sans transtypage
Rgraphviz.c:436: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agnxtnode »
Rgraphviz.c: Au niveau supérieur:
Rgraphviz.c:444: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
Rgraphviz.c: Dans la fonction « getEdgeLocs »:
Rgraphviz.c:447: « Agnode_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:447: « node » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:447: « head » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:447: AVERTISSEMENT: l'opérande à gauche de la virgule dans
l'expression n'a pas d'effet
Rgraphviz.c:448: « Agedge_t » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:448: « edge » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:450: « bezier » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:450: erreur d'analyse syntaxique avant « bez »
Rgraphviz.c:465: « numEdges » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:467: « g » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:471: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agfstout »
Rgraphviz.c:474: « bez » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:523: AVERTISSEMENT: passage de arg 1 de « R_scalarString »
transforme en pointeur un entier sans transtypage
Rgraphviz.c:525: AVERTISSEMENT: passage de arg 1 de « R_scalarString »
transforme en pointeur un entier sans transtypage
Rgraphviz.c:527: AVERTISSEMENT: passage de arg 1 de « R_scalarString »
transforme en pointeur un entier sans transtypage
Rgraphviz.c:530: AVERTISSEMENT: passage de arg 1 de « R_scalarString »
transforme en pointeur un entier sans transtypage
Rgraphviz.c:565: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agnxtout »
Rgraphviz.c: Au niveau supérieur:
Rgraphviz.c:578: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
Rgraphviz.c:578: erreur d'analyse syntaxique avant le jeton « * »
Rgraphviz.c:578: AVERTISSEMENT: le défaut choisi du type retourné est «
int »
Rgraphviz.c: Dans la fonction « setDefaultAttrs »:
Rgraphviz.c:587: « attrs » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:591: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agraphattr »
Rgraphviz.c:591: « g » non déclaré (première utilisation dans cette
fonction)
Rgraphviz.c:600: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agnodeattr »
Rgraphviz.c:608: AVERTISSEMENT: déclaration implicite de la fonction «
agedgeattr »
make: *** [Rgraphviz.o] Erreur 1
ERROR: compilation failed for package 'Rgraphviz'
** Removing '/usr/lib/R_HOME/library/Rgraphviz'
>From URL:  http://www.bioconductor.org/repository/release1.4/package/Source
        Rgraphviz version 1.4.0

Warning message:
Installation of package Rgraphviz had non-zero exit status in:
installPkg(fileName, pkg, pkgVer, type, lib, repEntry, versForce)

********************************************
Nolwenn Le Meur
INSERM U533
Faculté de médecine
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