### R code from vignette source 'kstIO.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: kstIO.Rnw:59-64 ################################################### options(width = 80) library("kstIO") library("kst") wd <- getwd() setwd(tempdir()) ################################################### ### code chunk number 2: write-functions ################################################### # Obtain data from the pks package data(DoignonFalmagne7) ksp <- kspace(kstructure(as.pattern(DoignonFalmagne7$K, as.set=TRUE))) b <- kbase(ksp) d <- as.binmat(DoignonFalmagne7$N.R, uniq=FALSE) r <- as.relation(ksp) ksp b head(d) # Write data to files write_kstructure(ksp, "DF7.struct") write_kspace(ksp, "DF7.space", format="matrix") write_kbase(b, "DF7.bas", format="KST") write_kdata(d, "DF7.data", format="SRBT") write_surmiserelation(r, "DF7.rel") ################################################### ### code chunk number 3: show_example-file ################################################### txt <- readLines("DF7.bas") for (i in txt) cat(paste(i, "\n", sep="")) ################################################### ### code chunk number 4: read-functions ################################################### # Read the data files stored before read_kfamset("DF7.space") read_kstructure("DF7.struct", format="SRBT") read_kspace("DF7.space", format="matrix") read_kbase("DF7.bas", format="auto") head(read_kdata("DF7.data")) read_surmiserelation("DF7.rel") ################################################### ### code chunk number 5: kstIO.Rnw:263-264 ################################################### setwd(wd)